MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Muricauda ruestringensis DSM 13258 chromosome

Total Repeats: 65922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015945	AAC	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
2	NC_015945	GAA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
3	NC_015945	TAA	2	6	371	376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201338
4	NC_015945	A	6	6	470	475	100 %	0 %	0 %	0 %	344201338
5	NC_015945	CAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
6	NC_015945	ATT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
7	NC_015945	TGG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201338
8	NC_015945	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	344201338
9	NC_015945	CAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
10	NC_015945	TA	3	6	759	764	50 %	50 %	0 %	0 %	344201338
11	NC_015945	AGTC	2	8	766	773	25 %	25 %	25 %	25 %	344201338
12	NC_015945	TTA	2	6	826	831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
13	NC_015945	TGA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201338
14	NC_015945	TTTC	2	8	878	885	0 %	75 %	0 %	25 %	344201338
15	NC_015945	GCAA	2	8	913	920	50 %	0 %	25 %	25 %	344201338
16	NC_015945	ATCC	2	8	1040	1047	25 %	25 %	0 %	50 %	344201338
17	NC_015945	GAA	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
18	NC_015945	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
19	NC_015945	TAT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
20	NC_015945	ATT	2	6	1149	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201338
21	NC_015945	ATTG	2	8	1157	1164	25 %	50 %	25 %	0 %	344201338
22	NC_015945	CTTC	2	8	1171	1178	0 %	50 %	0 %	50 %	344201338
23	NC_015945	CAA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201338
24	NC_015945	AGT	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201338
25	NC_015945	GAA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201338
26	NC_015945	CTT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201338
27	NC_015945	CCG	2	6	1823	1828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201339
28	NC_015945	CCA	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201339
29	NC_015945	CAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201339
30	NC_015945	T	6	6	1941	1946	0 %	100 %	0 %	0 %	344201339
31	NC_015945	A	6	6	2007	2012	100 %	0 %	0 %	0 %	344201339
32	NC_015945	AGG	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201339
33	NC_015945	ATT	3	9	2037	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201339
34	NC_015945	AAG	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201339
35	NC_015945	TTA	2	6	2085	2090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201339
36	NC_015945	TGG	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201339
37	NC_015945	TGA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201339
38	NC_015945	AAT	2	6	2124	2129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201339
39	NC_015945	A	6	6	2155	2160	100 %	0 %	0 %	0 %	344201339
40	NC_015945	TTG	2	6	2384	2389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201340
41	NC_015945	AGA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201340
42	NC_015945	TAT	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201340
43	NC_015945	A	6	6	2526	2531	100 %	0 %	0 %	0 %	344201340
44	NC_015945	TGG	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201340
45	NC_015945	CTC	2	6	2560	2565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201340
46	NC_015945	ATG	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201340
47	NC_015945	A	7	7	2651	2657	100 %	0 %	0 %	0 %	344201340
48	NC_015945	AAC	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201340
49	NC_015945	TTGC	2	8	2787	2794	0 %	50 %	25 %	25 %	344201340
50	NC_015945	TCC	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201340
51	NC_015945	AT	4	8	2882	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	344201340
52	NC_015945	A	7	7	2901	2907	100 %	0 %	0 %	0 %	344201340
53	NC_015945	CTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201341
54	NC_015945	TAC	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201341
55	NC_015945	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201341
56	NC_015945	ACC	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201341
57	NC_015945	A	6	6	3247	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	344201341
58	NC_015945	TAC	3	9	3287	3295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201341
59	NC_015945	AGG	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201341
60	NC_015945	CCTCGT	2	12	3416	3427	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344201341
61	NC_015945	AAG	2	6	3429	3434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201341
62	NC_015945	TTC	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201341
63	NC_015945	GTA	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201341
64	NC_015945	TAT	2	6	3752	3757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201342
65	NC_015945	TCA	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201342
66	NC_015945	TTG	2	6	3769	3774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201342
67	NC_015945	CAAC	2	8	3778	3785	50 %	0 %	0 %	50 %	344201342
68	NC_015945	T	6	6	4042	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	344201342
69	NC_015945	ATAA	2	8	4054	4061	75 %	25 %	0 %	0 %	344201342
70	NC_015945	CAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201342
71	NC_015945	TCA	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201342
72	NC_015945	AGA	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201342
73	NC_015945	GT	3	6	4334	4339	0 %	50 %	50 %	0 %	344201342
74	NC_015945	A	7	7	4361	4367	100 %	0 %	0 %	0 %	344201342
75	NC_015945	TCCT	2	8	4425	4432	0 %	50 %	0 %	50 %	344201342
76	NC_015945	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201342
77	NC_015945	GTT	3	9	4513	4521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201342
78	NC_015945	T	6	6	4529	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	344201342
79	NC_015945	AT	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	344201342
80	NC_015945	CAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201342
81	NC_015945	TCA	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201342
82	NC_015945	TTA	2	6	4685	4690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201342
83	NC_015945	CAA	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201342
84	NC_015945	T	6	6	4783	4788	0 %	100 %	0 %	0 %	344201342
85	NC_015945	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201343
86	NC_015945	TCT	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201343
87	NC_015945	TCT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201343
88	NC_015945	TAAA	2	8	4894	4901	75 %	25 %	0 %	0 %	344201343
89	NC_015945	CA	3	6	4975	4980	50 %	0 %	0 %	50 %	344201343
90	NC_015945	GCCC	2	8	5048	5055	0 %	0 %	25 %	75 %	344201343
91	NC_015945	ATCA	2	8	5084	5091	50 %	25 %	0 %	25 %	344201343
92	NC_015945	ATC	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201343
93	NC_015945	TGA	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201343
94	NC_015945	GTT	2	6	5134	5139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201343
95	NC_015945	T	6	6	5189	5194	0 %	100 %	0 %	0 %	344201343
96	NC_015945	ACGC	2	8	5281	5288	25 %	0 %	25 %	50 %	344201343
97	NC_015945	TG	3	6	5342	5347	0 %	50 %	50 %	0 %	344201344
98	NC_015945	CTC	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201344
99	NC_015945	AT	3	6	5602	5607	50 %	50 %	0 %	0 %	344201344
100	NC_015945	T	6	6	5620	5625	0 %	100 %	0 %	0 %	344201344
101	NC_015945	CTT	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201344
102	NC_015945	TTC	2	6	5648	5653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201344
103	NC_015945	TGG	2	6	5675	5680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201344
104	NC_015945	A	6	6	5696	5701	100 %	0 %	0 %	0 %	344201344
105	NC_015945	GTTTT	2	10	5707	5716	0 %	80 %	20 %	0 %	344201344
106	NC_015945	ATC	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201344
107	NC_015945	AAT	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201344
108	NC_015945	CCA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201344
109	NC_015945	TCC	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201344
110	NC_015945	TAC	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201344
111	NC_015945	AAG	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201344
112	NC_015945	AAT	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201344
113	NC_015945	A	6	6	6073	6078	100 %	0 %	0 %	0 %	344201344
114	NC_015945	GAA	2	6	6228	6233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201345
115	NC_015945	ATT	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201345
116	NC_015945	T	6	6	6298	6303	0 %	100 %	0 %	0 %	344201345
117	NC_015945	GAAA	2	8	6306	6313	75 %	0 %	25 %	0 %	344201345
118	NC_015945	ACC	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201345
119	NC_015945	GGC	2	6	6417	6422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201345
120	NC_015945	GGT	2	6	6441	6446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201345
121	NC_015945	A	6	6	6453	6458	100 %	0 %	0 %	0 %	344201345
122	NC_015945	CAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201345
123	NC_015945	TTA	2	6	6551	6556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201345
124	NC_015945	AT	3	6	6570	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	344201345
125	NC_015945	CAA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201345
126	NC_015945	AAT	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201345
127	NC_015945	TGC	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201345
128	NC_015945	GTG	3	9	6902	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201345
129	NC_015945	A	6	6	7015	7020	100 %	0 %	0 %	0 %	344201345
130	NC_015945	GTG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201345
131	NC_015945	CTG	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201345
132	NC_015945	AGC	2	6	7098	7103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201345
133	NC_015945	GAA	3	9	7153	7161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201345
134	NC_015945	GAT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201345
135	NC_015945	TCA	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201345
136	NC_015945	A	7	7	7204	7210	100 %	0 %	0 %	0 %	344201345
137	NC_015945	ACA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201345
138	NC_015945	TTC	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201345
139	NC_015945	CTT	2	6	7367	7372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201345
140	NC_015945	AGA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201345
141	NC_015945	A	6	6	7473	7478	100 %	0 %	0 %	0 %	344201345
142	NC_015945	ATT	2	6	7486	7491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201345
143	NC_015945	AAATA	2	10	7503	7512	80 %	20 %	0 %	0 %	344201345
144	NC_015945	ACC	2	6	7814	7819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201346
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146	NC_015945	GGT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
147	NC_015945	CCTC	2	8	8008	8015	0 %	25 %	0 %	75 %	344201346
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149	NC_015945	TGG	2	6	8181	8186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
150	NC_015945	GTT	2	6	8240	8245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201346
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152	NC_015945	A	6	6	8277	8282	100 %	0 %	0 %	0 %	344201346
153	NC_015945	AGC	2	6	8284	8289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201346
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157	NC_015945	ACA	2	6	8478	8483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201346
158	NC_015945	AAG	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201346
159	NC_015945	CAC	2	6	8629	8634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201346
160	NC_015945	A	6	6	8684	8689	100 %	0 %	0 %	0 %	344201346
161	NC_015945	TGG	2	6	8733	8738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
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163	NC_015945	CGC	2	6	8759	8764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201346
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165	NC_015945	AAAG	2	8	8933	8940	75 %	0 %	25 %	0 %	344201346
166	NC_015945	CAT	2	6	8950	8955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201346
167	NC_015945	A	7	7	8956	8962	100 %	0 %	0 %	0 %	344201346
168	NC_015945	TGG	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
169	NC_015945	CAAAT	2	10	8990	8999	60 %	20 %	0 %	20 %	344201346
170	NC_015945	CAC	2	6	9040	9045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201346
171	NC_015945	TA	3	6	9108	9113	50 %	50 %	0 %	0 %	344201346
172	NC_015945	AT	3	6	9166	9171	50 %	50 %	0 %	0 %	344201346
173	NC_015945	TAT	2	6	9194	9199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201346
174	NC_015945	GTG	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201346
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176	NC_015945	CTT	2	6	9356	9361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201347
177	NC_015945	AAG	2	6	9373	9378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201347
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180	NC_015945	GAAA	2	8	9432	9439	75 %	0 %	25 %	0 %	344201347
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244	NC_015945	GAAG	2	8	13579	13586	50 %	0 %	50 %	0 %	344201351
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249	NC_015945	A	7	7	13839	13845	100 %	0 %	0 %	0 %	344201351
250	NC_015945	CAA	2	6	13846	13851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201351
251	NC_015945	GAA	2	6	13895	13900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201351
252	NC_015945	CAAG	2	8	13999	14006	50 %	0 %	25 %	25 %	344201351
253	NC_015945	GAG	2	6	14066	14071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201351
254	NC_015945	TAC	2	6	14126	14131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201351
255	NC_015945	ATAA	2	8	14206	14213	75 %	25 %	0 %	0 %	344201351
256	NC_015945	ACA	2	6	14298	14303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201352
257	NC_015945	CAA	2	6	14312	14317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201352
258	NC_015945	ACC	2	6	14409	14414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201352
259	NC_015945	GCTCCT	2	12	14451	14462	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344201352
260	NC_015945	TAA	2	6	14545	14550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201352
261	NC_015945	TGA	2	6	14561	14566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201352
262	NC_015945	GAA	2	6	14671	14676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201352
263	NC_015945	CTC	2	6	14689	14694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201352
264	NC_015945	CTT	2	6	14752	14757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201352
265	NC_015945	AAC	2	6	14853	14858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201352
266	NC_015945	CTT	2	6	14974	14979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201352
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381	NC_015945	AC	3	6	21507	21512	50 %	0 %	0 %	50 %	344201360
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396	NC_015945	AAC	2	6	22977	22982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201362
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401	NC_015945	ATC	2	6	23195	23200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201362
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404	NC_015945	TCT	2	6	23361	23366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201363
405	NC_015945	TCA	2	6	23399	23404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201363
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499	NC_015945	T	7	7	28620	28626	0 %	100 %	0 %	0 %	344201368
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